健康肠道的益处
排便
细菌所产生的丁酸能够使肠道的蠕动变得更加活跃。某些好细菌能够分泌出丁酸的一种短链脂肪酸。实际上这是一种大肠非常喜爱的物质。大肠摄取丁酸，作为能量源加以利用。这样一来蠕动得到促进，使排便变得通畅。据了解，大肠消费的能量当中，有10%左右来自肠道内细菌。
减肥
容易发胖与肠道内细菌有关。通过肠道内细菌与肥胖关系的对比研究，发现了肥胖者体内较多的细菌和较瘦的人体内较多的细菌。给肥胖的实验鼠喂食肥胖时会减少的细菌后发现，实验鼠的肥胖得到了改善。减肥有望迎来从肠道内开始的时代。
大脑的发育
肠道内如果没有细菌大脑的成长会发生异变。据发现，出生后便在无菌环境中饲养的实验鼠，与普通的实验鼠相比，察觉并避免危险的能力较弱。这被认为是因为大脑中神经递质的一种比普通实验鼠少的缘故。看来为了获得健全的“脑力”，健全的肠道内细菌很重要。
提升免疫力
在肠道内细菌的刺激可使免疫系统变得活跃。肠道是免疫功能非常活跃的器官。小肠中叫做派氏结的器官向肠道内释放出免疫蛋白（IgA），以抵御病原菌等的入侵。然而，肠道内的细菌却不受免疫系统的攻击。不仅如此，据了解，在肠道内细菌的刺激下，派氏结的作用还会有所提高。
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